下列基因突變的紀錄，何者錯誤？

本題觀念：

HGVS（Human Genome Variation Society）命名法中，coding DNA（c.）層級的插入（insertion）、重複（duplication）、取代（substitution）等變異必須嚴格遵守格式：

• 插入（ins）的「positions_flanking」必須為連續相鄰的兩個位置（如123_124），不可跨越跳號。
• 重複（dup）用於說明序列直接3′端接一份與參考序列相同的拷貝，單核苷酸或多核苷酸皆可，格式為c.[位置]_?[位置]dup。
• 取代（substitution）以c.位置原核苷酸>新核苷酸表示。

選項分析

• 選項A c.1253_1254insC
  插入了「C」於1253與1254之間， flank positions 1253_1254相鄰且插入序列明確，符合 HGVS 插入規範 (hgvs-nomenclature.org)。

• 選項B c.324_329insGAAGT
  flank positions 標示為324_329，但324與329之間缺少325–328共四個位置，並非緊鄰，HGVS規定必須為相鄰，例如324_325ins…，此寫法錯誤 (hgvs-nomenclature.org)。

• 選項C c.1253dup
  單一核苷酸重複可簡寫為c.位置dup，例如c.20dup、c.5697dup，表示在該位置之後直接重複該核苷酸，符合HGVS重複規範 (hgvs-nomenclature.org)。

• 選項D c.250C>T
  核苷酸取代採用c.位置原核苷酸>替代核苷酸，如c.250C>T，正確地說明250位由C變T。此為標準substitution表示法。

答案解析

正確答案為B。選項B將flanking positions標示為324_329，然而插入必須定義插入位於兩個「相鄰」碱基之間，HGVS規範明確要求range必為連續（adjacent）位置，如123_124insACGT，才得以定位插入事件。324_329之間跨越多個位置，格式不被允許，因此為錯誤紀錄。

核心知識點

• HGVS命名法：coding DNA層級（c.）的insertion、duplication、substitution基本格式
• 插入（ins）：positions_flanking必為相鄰，如c.123_124insAT；插入序列需明確列出 (hgvs-nomenclature.org)
• 重複（dup）：單位或區段直接3′接複本，用c.posdup或c.pos1_pos2dup表示 (hgvs-nomenclature.org)
• 取代（substitution）：c.pos原核苷酸>新核苷酸
• 「3′ rule」：對於del/dup/ins，優先賦予最3′可能的位置，但本題不牽涉shift

臨床重要性

精確的變異命名對臨床遺傳檢測報告與文獻溝通至關重要，可避免不同實驗室或資料庫間的歧義。對插入與重複事件定位不當，可能導致錯誤解讀致病性或臨床決策偏差。