113年:(醫檢)檢驗(2)

病人的EGFR基因經定序後,如何得知具有DNA突變或單一核苷酸變異?

A使用blastn比對定序結果與EGFR標準基因序列
B使用blastp比對定序結果與EGFR標準基因序列
C使用blastx比對定序結果與EGFR標準基因序列
D使用tblastx比對定序結果與EGFR標準基因序列

詳細解析

本題觀念

重點在「序列比對方法選擇」,針對已獲得的EGFR基因核酸序列,需與標準參考序列在核苷酸層次直接比對,才能準確找出單一核苷酸變異(SNV)或其他突變型態。

選項分析

  • 選項A 使用 blastn 比對定序結果與 EGFR 標準基因序列
    blastn 直接將核酸(DNA/RNA)查詢序列比對到核酸資料庫,能呈現每一個位置的錯配、插入或缺失,最適用於偵測 SNV 或其他核酸層次突變(transcriptome.riken.jp)。

  • 選項B 使用 blastp 比對定序結果與 EGFR 標準基因序列
    blastp 只能處理蛋白質序列查詢與蛋白質資料庫比對,不處理核酸序列,也無法顯示核酸層次的錯配細節,故不適用於DNA突變檢測(transcriptome.riken.jp)。

  • 選項C 使用 blastx 比對定序結果與 EGFR 標準基因序列
    blastx 會將核酸

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