113年:(醫檢)檢驗(1)

設計PCR條件時,引子(primer)黏合到DNA 模板(annealing)的溫度需要被優化。下列何者與決定annealing反應之最適溫度最無關?

APCR緩衝液之鹽類濃度
B引子的GC content
CPCR產物的片段長度
D引子有mismatches的序列

詳細解析

本題觀念:

本題聚焦在PCR反應中的「annealing temperature(引子與模板DNA結合溫度)」之優化設計。annealing溫度需依據primer-template duplex的穩定性來設定,過高會造成引子無法有效結合、產量下降;過低則易導致non-specific binding,產出假陽性或雜訊條帶。

選項分析

  • 選項A:PCR緩衝液之鹽類濃度
    PCR反應中鹽類(如Na⁺、Mg²⁺)會影響DNA雙股的穩定性,鹽濃度越高,負電荷間的排斥作用被屏蔽,雙股更穩定,Tm會上升,因此salt correction是Tm計算中重要一環 (cloud.tencent.com)。

  • 選項B:引子的GC content
    GC pair間有三條氫鍵,比AT pair的兩條氫鍵更穩定。primer中GC含量越高,duplex穩定性越高,Tm越大,annealing溫度要相應提高 (medicilon.com)。

  • 選項C:PCR產物的片段長

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