115年:(醫檢)檢驗(1)

病毒基因型與疾病病程或治療策略有關,下列何者最不適合用來做病毒基因型鑑定?

Asequencing
Bnucleic acid sequence-based amplification (NASBA)
Creverse hybridization
Dhybridization onto high-density microarrays

詳細解析

本題觀念:

本題考查的是病毒基因型鑑定 (Viral Genotyping) 的常用實驗室方法,並需區分「定性/基因分型」與「定量 (Viral Load)」檢測技術的適用性。

基因型鑑定 (Genotyping) 的目的是區分病毒的亞型 (Subtypes) 或檢測特定的抗藥性突變,這通常需要辨識核酸序列上的具體差異 (Sequence specific identification)。

選項分析

  • A. Sequencing (定序)

    • 分析:定序 (如 Sanger sequencing 或 Next-Generation Sequencing) 是基因型鑑定的黃金標準 (Gold Standard)。它可以直接讀取病毒核酸的鹼基序列,準確區分不同基因型 (如 HCV 分型) 或偵測抗藥性突變 (如 HIV, HBV, CMV 抗藥性測試)。
    • 結論:非常適合。
  • B. Nucleic acid sequence-based amplification (NASBA)

    • 分析:NASBA 是一種恆溫核酸放大技術 (Isothermal amplification),主要針對 RNA 進行擴增。在臨床病毒學中,NASBA 最主要的應用是病毒載量定量 (Viral Load Quantification) (例如:早期測量 HIV-1 RNA copy number)。
    • 理由:雖然 NASBA 結合特定的探針 (如 Molecular Beacons) 技術上可以設計用來偵測特定點突變,但其核心本質是「擴增技術」,且在臨床常規上,NASBA 並非用來進行廣泛基因分型 (Genotyping) 的首選平台。相比之下,定序、晶片和反向雜交都是專門設計來解析序列差異的分析平台。因此,在選項中最不適合作為「基因型鑑定」的通用工具。
    • 結論最不適合 (主要用於定量)。
  • C. Reverse hybridization (反向雜交)

    • 分析:這是臨床上非常普遍的基因分型方法,最著名的例子是 Line Probe Assay (LiPA)
    • 原理:將針對不同基因型設計的特異性探針固定在膜條上,讓病毒 PCR產物與之雜交。根據顯色條帶的位置來判斷病毒屬於哪一型 (例如:HCV Genotyping, HPV Genotyping)。
    • 結論:非常適合。
  • D. Hybridization onto high-density microarrays (高密度微陣列晶片雜交)

    • 分析:基因晶片 (Microarray) 利用高密度的探針矩陣,可以同時偵測成千上萬個基因序列變異或單核苷酸多型性 (SNPs)。
    • 應用:常用於大規模的病原體篩檢、複雜的基因分型或抗藥性位點分析 (如 Influenza 分型、SARS-CoV-2 變異株監測研究)。
    • 結論:非常適合。

答案解析

正確答案:B

題目詢問「最不適合」用來做病毒基因型鑑定的方法。

  • 選項 A (定序)C (反向雜交/LiPA)D (微陣列晶片) 都是臨床與研究上定義病毒基因型的主要工具,原理皆是基於對序列差異的直接讀取或特異性探針雜交。
  • 選項 B (NASBA) 雖然是一種核酸放大技術,但其在臨床檢驗的主要角色是 RNA 病毒的定量 (Viral Load) (如 HIV-1 RNA 定量),而非基因分型。雖然 NASBA 產物後續可以用來定序或雜交,但單純的 NASBA 技術本身主要用於「放大與定量」,對多樣化基因型的解析能力不如其他三個選項專精。

核心知識點

考生應掌握常見分子診斷技術的主要臨床用途

  1. 基因型鑑定 (Genotyping) / 抗藥性分析

    • Sequencing (定序):黃金標準 (Gold standard)。
    • Reverse Hybridization (Line Probe Assay, LiPA):常用於 HCV, HBV, HPV 分型。
    • Microarray (晶片):高通量篩檢與分型。
    • RFLP (限制酶片段長度多型性):傳統方法,利用酶切圖譜分型。
  2. 病毒載量定量 (Viral Load Quantification)

    • Real-time PCR (qPCR):目前最主流。
    • NASBA (Nucleic Acid Sequence-Based Amplification):恆溫擴增 RNA,專長於 RNA 病毒定量。
    • bDNA (Branched DNA):訊號放大技術,不擴增目標核酸,用於定量。

參考資料

  1. Clinical Virology Manual: Molecular Diagnosis methods - Genotyping vs Quantification.
  2. CDC Guidelines for Hepatitis C: Use of Line Probe Assays and Sequencing for HCV Genotyping.
  3. NASBA Technology: BioMérieux NucliSens® (NASBA primarily marketed for HIV-1 viral load monitoring).