110年:(醫檢)檢驗(1)
下列何種技術最適合應用於 single nucleotide polymorphism arrays （ SNP arrays ）上？
A單股結構多型性（ Single-strand conformation polymorphism analysis ）
B聚合酶連鎖反應－限制酶片段長度多型性（ PCR-RFLP ）
C單一鹼基延長作用（ Single base extension, SBE ）
D變性梯度膠體電泳法（ Denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE ）
詳細解析
本題觀念：
本題考查的是 SNP 微陣列晶片（SNP Array） 的核心運作原理與其適用的生化反應技術。SNP Array 是一種高通量基因分型技術，能在一次試驗中同時檢測數十萬至數百萬個單核苷酸多型性（Single Nucleotide Polymorphism, SNP）位點。目前主流的 SNP Array 平台（如 Illumina 與 Affymetrix）所採用的核心原理主要分為「單一鹼基延長法（Single Base Extension, SBE）」與「差異雜交法（Differential Hybridization）」。
選項分析
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A. 單股結構多型性（Single-strand conformation polymorphism analysis, SSCP）：
- 錯誤。SSCP 是一種基於電泳的突變篩檢技術。其原理是將 DNA 變性為單股後，利用序列差異導致單股 DNA 二級結構（Conformation）改變，進而在非變性聚丙烯醯胺凝膠（Polyacrylamide gel）中產生不同的電泳移動速度。
- 此方法主要用於「篩檢」未知突變，且依賴凝膠電泳，難以應用於高密度微陣列晶片（Array）平台。
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B. 聚合酶連鎖反應－限制酶片段長度多型性（PCR-RFLP）：
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