108年:(醫檢)檢驗(2)
關於美國 National Center for Biotechnology Information (NCBI )系統之 BLAST 的敘述,下列何者錯誤?
A以核酸序列來比對核酸資料庫系統
B以蛋白質 胺基酸序列來比對胺基酸資料庫
C可得知兩個互相比對的序列之間的相似度
D只能針對人類基因進行比對,不適用於分析其他生物體
詳細解析
本題觀念:
本題考 NCBI 的 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)工具的功能與適用範圍。BLAST 是生物資訊學(bioinformatics)中最重要的序列比對工具,能比對所有生物物種的核酸或蛋白質序列,並非僅限於人類。本題為反向題(問「何者錯誤」)。
選項分析
(A) 以核酸序列來比對核酸資料庫系統 ✅ 正確陳述 BLASTn(Nucleotide BLAST)即以核酸序列查詢核酸資料庫(如 NCBI nt 資料庫),此功能正確無誤。
(B) 以蛋白質胺基酸序列來比對胺基酸資料庫 ✅ 正確陳述 BLASTp(Protein BLAST)以蛋白質胺基酸序列查詢蛋白質資料庫(如 nr 資料庫),此功能正確。此外 BLASTx 可將核酸序列六框翻譯後與蛋白質資料庫比對。
(C) 可得知兩個互相比對的序列之間的相似度 ✅ 正確陳述 BLAST 的核心功能之一即計算查詢序列(query)與資料庫序列(subject)的相似度(identity %)及統計顯著性(E-value、bit score),此陳述正確。
(D) 只能針對人類基因進行比對,不適用於分析其他生物體 ❌ 錯誤陳述 = 答案 NCBI BLAST 的資料庫(如 nt、nr)收錄所有物種
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