108年:(醫檢)檢驗(1)

利⽤增幅阻礙突變系統( Amplification refractory mutation system )偵測 single nucleotide polymorphism(SNP )時,需將欲分析之 SNP 設計於引⼦的何處?

A5' 端第⼀個核 苷酸
B3' 端最後⼀個核 苷酸
C中間位置
D任意位置皆可

詳細解析

本題觀念:

增幅阻礙突變系統(Amplification Refractory Mutation System, ARMS),又稱等位基因專一性 PCR(allele-specific PCR, AS-PCR),是偵測單核苷酸多型性(single nucleotide polymorphism, SNP)的重要分子診斷技術。其核心原理依賴引子(primer)3' 端最後一個核苷酸的配對特異性。

選項分析

(A) 5' 端第一個核苷酸 — 錯誤。引子 5' 端的序列雖影響 TmT_m 值,但 DNA 聚合酶(DNA polymerase)的延伸方向為 5'→3',5' 端錯誤配對不影響延伸的啟動,故不能用於等位基因辨別。

(B) 3' 端最後一個核苷酸 — 正確。Taq DNA 聚合酶缺乏 3'→5' 校對活性(proofreading activity),因此若引子 3' 端最後一個核苷酸與模板不配對,延伸效率極低甚至無法啟動。ARMS 的設計正是將欲偵測的 SNP 位點置於引子的 3' 端,若模板序列與該等位基因相符,即可有效擴增;若不符,則無擴增產物。

(C) 中間位置 — 錯誤。引子中間位置的單一錯誤配對通常不足以完全抑制 PCR 延伸,因此無法有效區分不同等位基因。

(D) 任意位置皆可 — 錯誤。位置至關重要,只有

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