105年:醫學二(1)
5'-CCAAGTCCATGGACTTGG-3'DNA 分子可以形成何種二級結構?
AA form
BH form
CZ form
Dcruciform
詳細解析
本題觀念:
本題考察 DNA 序列的自我互補性(self-complementarity)與可形成的二級結構。分析關鍵:判斷 5'-CCAAGTCCATGGACTTGG-3' 是否為回文序列(palindrome),以及在 dsDNA 形式下可形成的二級結構。
序列分析:
- 原始序列(5'→3'):
CCAAGTCCATGGACTTGG - 互補鏈(3'→5'):
GGTTCAGGTACCTGAACC - 互補鏈反向(5'→3'):
CCAAGTCCATGGACTTGG
該序列的反向互補(reverse complement)與自身完全相同,因此這是一個18 bp 的完美回文序列(perfect palindrome)。
選項分析
(A) A form 不正確。A 型 DNA(A-form DNA)是 DNA 在低水分條件下或 DNA-RNA 雜交鏈形成的右旋螺旋,每圈 11 個鹼基對,螺旋較短寬。A form 是整體雙股螺旋的構型,不是基於特殊序列特徵形成的二級結構,與本序列無關。
(B) H form 不正確。H form(H-DNA)是三股螺旋(triplex DNA),需要嘌呤-嘧啶鏡像重複序列(polypurine-polypyrimidine mirror repeats),在酸性條件(pH <
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