106年:(醫檢)檢驗(2)
承上題【大約 20% 的A型血友病患者,其凝血因子基因在細胞進行減數分裂時發生同源互換( Homologous recombination )而產生下列何種變異?】,下列何種分子診斷技術最適合用來偵測此種變異?
A變性高效能液相層析分析( dHPLC )
B長片段聚合 酶連鎖反應( Long-distance PCR )
C北方墨點法( Northern blot )
D即時 PCR (Real-time PCR )
詳細解析
本題觀念:
本題承接上題,確認A型血友病(Hemophilia A)因FVIII基因同源互換產生**基因反轉(gene inversion)**後,詢問最適合偵測此種大型結構性變異(large structural variant)的分子診斷技術。偵測基因反轉的挑戰在於:反轉片段巨大(第22內含子反轉涉及186 kb 的 0.6 Mb片段;第1內含子反轉涉及140 kb),常規PCR無法跨越這麼長的片段進行擴增。
選項分析
(A) 變性高效能液相層析分析(dHPLC, Denaturing High-Performance Liquid Chromatography) dHPLC 用於偵測**點突變(point mutations)**和小型插入/缺失(small indels)。其原理是PCR產物在部分變性條件下形成異源雙鏈(heteroduplex),在層析管柱中分離異源雙鏈與同源雙鏈,藉此發現序列差異。dHPLC適合掃描數百鹼基的小片段,無法偵測大型基因反轉(因反轉不會產生異源雙鏈信號)。
(B) 長片段聚合酶連鎖反應(Long-distance PCR, LD-PCR) ✅ 正確答案 LD-PCR是一種改良的PCR技術,使用特化的熱穩定聚合酶(如含校正活性的混合酶)和優化的循環條件,能擴增長達20–30 kb的DN
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