下列何者方法最適合鑑定未知細菌抗藥性基因的變異？

本題觀念

此題探討在細菌基因體中如何「無偏地」且「全面地」偵測未知抗藥性基因或其變異。重點在於選擇最適合用於新變異（novel variant）發現的高通量定序（NGS）策略。

選項分析

• 選項A：全轉錄組定序（whole transcriptome sequencing）
  RNA-Seq 僅分析細胞中轉錄出的 RNA，著重基因表現量與轉錄本結構；若抗藥基因在特定條件下未被表現，或變異位於非轉錄區（例如調控序列、噬菌體插入元件），RNA-Seq 均無法涵蓋與偵測，故無法用於全面性的未知抗藥基因變異鑑定(en.wikipedia.org)。

• 選項B：全外顯子定序（whole exome sequencing）
  Exome sequencing 專為區域捕獲人類外顯子而設計，細菌沒有典型的外顯子／內含子結構，且此方法僅選定「已知」編碼區域；無法偵測細菌基因組中非編碼區或新穎基因，與本題需求不符。

• 選項C：全基因組定序（whole genome sequencing）
  WGS 以「無假設」方式讀取細菌整條染色體，能夠同時涵蓋所有編碼與非編碼區域，偵測已知與未知抗藥基因及其突變。不論是位於質體、染色體或移動遺傳

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