114年:(醫檢)檢驗(1)
關於可逆性中斷子定序法(reversible terminator-based sequencing)的敘述,下列何者最正確?
A正確配對的中斷子(terminator)不會發出螢光
B可逆性中斷子(reversible terminator)為雙去氧核苷酸(dideoxynucleotide)
C加入酸性溶液後,才可以繼續下一個鹼基的定序
D此法是運用乳化式增幅(emulsion amplification)原理
詳細解析
本題觀念
本題探討 Illumina 等次世代定序平台所使用的「可逆性中斷子定序法」(reversible terminator–based sequencing),其核心在於利用具有可逆阻斷基團(blocking group)的改造型 dNTP 作為暫停延伸的中斷子(terminator),並在定序反應每一週期除去螢光標記及阻斷基團,使 DNA 聚合酶得以繼續下一輪鹼基合成。
選項分析
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選項A
「正確配對的中斷子不會發出螢光」不符事實。Illumina SBS 化學反應中,每個可逆性中斷子均帶有螢光標記,並以不同波長對應四種鹼基,以利影像辨識。在成像前,標記的 terminator 已被聚合酶加入複本,故會發出螢光信號後才辨識鹼基。(illumina.com) -
選項B
「可逆性中斷子為雙去氧核苷酸(dideoxynucleotide)」錯誤。dideoxynucleotide(ddNTP)於 Sanger 定序中不可逆地終止合成,缺乏可恢復的 3′-OH;而可逆性中斷子是以改造型 deoxyn
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