114年:(醫檢)檢驗(1)

EML4-ALK是間變性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase, ALK)融合基因突變的一種,兩個基因融合的亞型常見有從EML4外顯子(2、6、13、14、15、18或20)結合到ALK外顯子20等數種。以RT-PCR利用EML4與ALK特異配對引子放大融合基因後進行分析。如果以EML4外顯子13搭配ALK外顯子20的引子做檢驗,無法檢測出下列那一種亞型?

AEML4(exon 13)-ALK(exon 20)
BEML4(exon 15)-ALK(exon 20)
CEML4(exon 20)-ALK(exon 20)
DEML4(exon 6)-ALK(exon 20)

詳細解析

本題觀念:

本題考察利用 RT-PCR 檢測 EML4-ALK 融合基因時,如何根據融合斷點選擇引子(primer)設計。關鍵在於前向引子所在的 EML4 外顯子必須存在於融合轉錄本中,才能與下游 ALK-exon20 的反向引子配對擴增。

選項分析

  • 選項 A:EML4(exon 13)-ALK(exon 20) 前向引子即設計於 EML4 exon 13,融合變異本身即是 exon 13 直接接到 ALK exon 20,包含前向引子完整序列,能成功結合並擴增。因此可檢出。
    (aacrjournals.org)

  • 選項 B:EML4(exon 15)-ALK(exon 20) 此變異融合 EML4 exon 15 至 ALK exon 20,轉錄本包含 EML4 exons 1–15,自然包含 exon 13,前向引子可結合於 exon 13,故能檢出。
    ([aacrjournals.org](https://aacrjournals.org

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