114年:(醫檢)檢驗(2)

如圖為genomic DNA 經過bisulfite conversion 後,利用圖中所示探針進行 MethyLight 分析所得之擴增曲線,下列敘述何者最不適當? 圖片描述

A此區域中有 4個CpG位點
B可用於檢測腫瘤檢體中抑癌基因啟動子區域是否有高度甲基化的現象
Ca曲線是基因啟動子區域沒有甲基化的結果
D可選用富含 CpG位點的Alu elements 來作為DNA input control

詳細解析

本題觀念:

本題聚焦於 MethyLight(甲基化特異性實時定量 PCR)技術之原理:利用 sodium bisulfite 處理後的 DNA,將未甲基化的胞嘧啶(C)轉化為尿嘧啶(U,再於 PCR 中呈現為 T),而保留 5-methylcytosine 於 CpG 位點,使得設計含有 CpG 的探針或引子只會與甲基化序列完全互補並產生訊號,透過探針螢光強度與循環數關係判讀該位點之甲基化程度。

影像分析:

圖中呈現兩條擴增曲線,曲線 a 在第十多個循環即進入指數增幅期,螢光強度顯著上升;曲線 b 始終接近背景而無擴增。由上方標示的探針序列 “6FAM-ACCCGACCCCGAACCGCG-MGBNFQ” 可見其含有多個 CpG 位點,僅在這些胞嘧啶被甲基化、 bisulfite 處理後仍保有 “CG” 配對時,探針才能完全互補偵測,PCR 才順利進行並產生螢光。因此曲線 a 代表樣本中該區域為甲基化狀態;曲線 b 則代表該區幾乎無甲基化訊號。

選項分析

  • 選項A “此區域中有 4 個 CpG 位點”:從探針序列 ACCCGACCCCGAACCGCG 中,以 C (第4位)–G(第5位)、C(第10位)–G(第11位)、C(第15位)–G(第16位)、C(第17位)–G(第18位) 等共 4 組 CpG 二核苷酸,可確定此區含 4 個 CpG,屬實。

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