113年:(醫檢)檢驗(2)

建構NGS文庫時,將DNA片段接上index或是bar code之最重要的目的為何?

A增加序列讀長
B可以在一次定序反應中同時分析多個檢體的序列
C可以同時增幅多個DNA片段
D協助DNA片段固定在定序晶片上

詳細解析

本題觀念:

將DNA片段接上index(又稱barcode)最主要的目的是讓多個樣本的文庫能在同一次測序反應中同時上機(pool),再根據序列中各自的index序列將讀取得以歸屬到不同樣本(sample demultiplexing) (eurofinsgenomics.com)。

選項分析

  • 選項A
    讀長(read length)由測序平台及所用試劑盒(如MiSeq v3、HiSeq X等)決定,與接上index/barcode本身無關,故此選項錯誤。

  • 選項B
    正確。index/barcode的關鍵功能即是實現multiplexing——將多個樣本各自加上不同barcode後混合(pool)至單一flow cell中同時測序,事後再以bioinformatic方式依序列中的barcode區分各樣本的reads (dnatech.ucdavis.edu)。

  • 選項C
    文庫中多個DNA片段的增幅(amplification)

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