113年:(醫檢)檢驗(1)
NPM1基因的變異常出現在血液腫瘤中,其中最常見的是在第十二外顯子(exon 12)有4 bp的插入(insertion)突變。假設野生型的序列 GCTATTCAAGATCTCTG▼GCAGTGGAGGAAGTCTCTT ,▼表示突變插入處。若以傳統的聚合酶連鎖反應配合桑格定序(Sanger sequencing),則最有可能有插入突變的定序圖為何?
A


B


C


D


詳細解析
本題觀念:
本題考察利用傳統聚合酶連鎖反應 (PCR) 加上桑格定序 (Sanger sequencing) 偵測 NPM1 基因第十二外顯子(exon 12)4 bp 插入突變時,異型合子(heterozygous)所造成的序列讀取特徵。重點在於異型合子 indel 造成的大小鏈錯位,導致突變起始點之後連續重疊訊號。
影像分析:
觀察四組定序染色峰圖 (chromatograms) 及其上方標註核苷酸:
- 選項 A:染色峰整體清晰,從 GCTATTCAAGATCTCT 直到後段 GCAGTGGAGGAAGTCTCTT 均為單一峰值,無任何重疊或不確定 (N) 標記,符合純合子 (homozygous wild-type) 定序結果。
- 選項 B:在定位至…CTCTG 之後,出現約五個連續“ N ”的訊號,之後又能恢復到單一清晰峰值,最後呈現 …GGAGGAAGTCTCTT。代表在該位置有突變導致短暫失序,但之後序列重新定向 (re-phasing)。
- 選項 C:從…CTCTG 開始即出現多重雜訊和連續不定義的 N (長長一串),伴隨持續重疊雙峰、三峰,訊號品質急遽下降,直到後段仍無法恢復清晰。典型異型合子插入突變 (heterozygous indel) 導致的錯位重疊效果,使野生型與突變型訊號無法對齊。
- 選項 D:出現四個 N 後緊接著一個 T,之
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