113年:(醫檢)檢驗(1)
下圖為次世代定序產出的序列比對結果,此為正股序列;若箭號處為發生基因變異的位點,則此位點產生了那種突變?
AT>C
BC>T
CA>G
DG>A
詳細解析
本題觀念:
NGS(Next-Generation Sequencing)序列比對結果中,必須判讀「reference allele」(參考序列)與「variant allele」(變異序列)之差異,並依據DNA四種鹼基之化學分類(嘌呤purine vs. 嘧啶pyrimidine)判定該點突變屬於transition(同類置換)或transversion(異類置換)(britannica.com)。
影像分析:
比對圖下方標示為「Reference seq」,箭頭所指位置該參考序列顯示為C(Cytosine)。對應上方多條NGS reads,在同一列皆觀察到T(Thymine)而非C,呈現高度一致性,顯示該位點實際讀出鹼基為T,與參考C明顯不同。此情形符合單核苷酸多態性(SNP)中C→T的碱基取代。
選項分析
- 選項A:T>C,意即參考位置原為T,變異為C。此題參考為C,故不符。
- 選項B:C>T,意即參考位置原為C,讀出變異為T,正好吻合影像所示C→T取代現象,屬於pyrimidine→pyrimidine的transition突變([en.wikipedia.org](https://en.wikip
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