111年:(醫檢)免疫病毒(2)

以核酸檢測方法來偵測冠狀病毒時,下列那一段基因區域最適合做為 Pan-CoV 分析的標的?

A刺突 S基因( Spike protein gene, S gene )
B複製酶開放讀框 ORF1a/b 基因( replicase ORF1a/b gene )
C反轉錄酶 RT基因( reverse transcriptase )
D嵌入酶基因( integrase )

詳細解析

本題觀念:

本題聚焦於核酸檢測(RT-PCR)中如何選擇最適合設計「泛冠狀病毒」(Pan-CoV)檢出之標的基因區域。因冠狀病毒種類繁多,須找出全屬(α、β、γ、δ)都高度保守的基因序列,以便構建能檢測所有已知及潛在新興冠狀病毒的通用檢測方法。

選項分析

  • 選項A 刺突 S基因(Spike protein gene, S gene)
    S基因屬於結構蛋白基因,介導受體結合與細胞入侵,但各冠狀病毒之間序列差異大,並非高度保守,不適合做為泛冠檢測之標的。

  • 選項B 複製酶開放讀框 ORF1a/b 基因(replicase ORF1a/b gene)
    ORF1a/b 轉譯後產生非結構蛋白 nsp1–16,其中 nsp12(RdRp, RNA-dependent RNA polymerase)序列在所有冠狀病毒中極度保守。許多泛冠RT-PCR之引子與探針即設計於此區域,可同時檢測 α、β、γ、δ 4個屬的冠狀病毒(pmc.ncbi.nlm.nih.gov)。

  • 選項C 反轉錄酶 RT基因(reverse transcriptase)
    冠狀病毒為正鏈RNA病毒,不含反轉錄酶基因;此基因存在於逆轉錄病毒,

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