DNA足跡鑑定（ DNA footprinting assay ）最適用於下列何種分析？

本題觀念：

DNA足跡鑑定（DNA footprinting assay） 是一種分子生物學技術，主要用於測定 DNA結合蛋白（DNA-binding proteins） 在 DNA 分子上的專一性結合序列位置。

其核心原理是利用酵素（如 DNase I）或化學試劑對 DNA 進行隨機切割。當某個特定的蛋白質（如轉錄因子）結合在 DNA 的特定序列上時，該蛋白質會「保護」這段 DNA 免受酵素切割。在電泳膠片（如聚丙烯醯胺凝膠 PAGE）上，未結合蛋白質的對照組會呈現連續的條帶（ladder），而結合蛋白質的實驗組則會在結合位置出現條帶缺失的區域，形成所謂的「足跡（footprint）」。

選項分析

• A. 一段基因編碼區的 5'端以及3'端的位置

  • 錯誤。測定基因轉錄產物（mRNA）或編碼區 5' 及 3' 端位置通常使用 RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)、S1 核酸酶定位分析 (S1 nuclease mapping) 或 引子延伸法 (Primer extension)。DNA footprinting 是用來看中間哪裡被蛋白質黏住，而非測定基因的邊界。

• B. 基因組中會與調控 RNA結合的位置

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