針對現行臺灣食品藥物管理署( Taiwan Food and Drug Administration, TFDA )所核准的病毒量檢測試劑,分析的目標基因及其對應的分析方式,下列敘述何者錯誤?
詳細解析
本題觀念:
本題考查的是臺灣食品藥物管理署(TFDA)核准之常見商業化病毒量檢測試劑(Viral Load Assays)的**標的基因(Target Gene)**與檢測原理。主要比較的廠牌為 Roche(cobas AmpliPrep/cobas TaqMan, CAP/CTM)與 Abbott(RealTime)。考生需掌握各家試劑為了涵蓋病毒變異(Subtypes/Genotypes)所設計的特定基因標的。
選項分析
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(A) cobas Ampliprep/cobas TaqMan 2.0 (Roche)檢測HIV-1,是利用 RT-qPCR去偵測gag與LTR —— <font color="green">正確</font>
- 分析:Roche 的 CAP/CTM HIV-1 v2.0 試劑是知名的「雙標的(Dual Target)」設計。為了改善前一代(v1.5, 僅偵測 gag)對特定亞型(如 CRF02_AG 等)可能出現的漏測或低估問題,v2.0 版同時偵測高度保留的 gag 基因與 LTR(Long Terminal Repeat)區域,以確保對各種 HIV-1 Group M 亞型及 Group O 的偵測敏感度與準確性。
- 結論:敘述正確。
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(B) cobas Ampliprep/cobas TaqMan 2.0 Test (Roche)檢測HCV,是利用 RT-qPCR去偵測5' UTR —— <font color="green">正確</font>
- 分析:Roche 的 CAP/CTM HCV v2.0 試劑主要標的為 HCV 基因體中最保留的 5' 非轉譯區(5' UTR)。雖然 Roche 更新的平台(如 cobas 6800/8800)採用了雙標的(5' UTR + Core)設計,但題目指定的 CAP/CTM v2.0 主要是針對 5' UTR 進行偵測(利用雙探針設計來涵蓋變異)。
- 結論:敘述正確。
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(C) RealTime (Abbott)檢測HIV-1,是利用 RT-qPCR去偵測pol —— <font color="red">錯誤</font>
- 分析:Abbott RealTime HIV-1 試劑的獨特設計在於它標定 pol 基因中的「整合酶(Integrase, IN)」區域。雖然 Integrase 屬於 pol 基因的一部分,但精確來說,該試劑是針對 Integrase 區域設計引物(Primers)與具錯配容忍度(Mismatch tolerance)的探針,而非針對一般所指的 pol(通常指反轉錄酶 RT 區域)或整個 pol 基因。
- 考點判斷:在國考題的邏輯中,若選項將 Abbott 的標的籠統稱為 pol,而未指出其具體的 Integrase 特異性,通常被視為不精確或錯誤的選項,特別是與其他選項(如 Roche 明確指出 gag/LTR)相比時。此外,早期許多針對 pol 的試劑多指 RT 區,而 Abbott 選擇 Integrase 是為了避開常見的抗藥性突變區並獲得高保留性。
- 結論:此選項敘述不夠精確或被視為錯誤。正確應指明偵測 Integrase 區域。
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(D) RealTime (Abbott)檢測HCV,是利用 RT-qPCR去偵測5' UTR —— <font color="green">正確</font>
- 分析:Abbott RealTime HCV 試劑的標的基因設計與大多數 HCV 試劑相同,是針對 HCV 基因體中高度保留的 5' UTR 區域進行擴增與偵測,以確保能涵蓋 HCV 的各種基因型(Genotypes 1-6)。
- 結論:敘述正確。
答案解析
本題正確答案為 (C)。
主要原因在於 Abbott RealTime HIV-1 試劑的核心技術特點是標定 HIV-1 的 Integrase (IN) 區域,而非籠統的 pol 基因(或傳統 pol 試劑常指的 RT 區)。Roche HIV-1 v2.0 採用 gag + LTR 雙標的策略是其標誌性特徵(選項 A 正確);而 HCV 檢測(無論 Roche CAP/CTM v2.0 或 Abbott RealTime)皆以 5' UTR 為主(選項 B、D 正確)。因此,選項 C 為最不適當的敘述。
核心知識點
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HIV-1 病毒量檢測標的:
- Roche (CAP/CTM v2.0):Dual Target (gag + LTR)。設計目的為避免單一基因突變導致的漏測。
- Abbott (RealTime):Single Target (Integrase region of pol)。利用此區高度保留性及特殊探針設計來涵蓋亞型。
- Roche (cobas 6800/8800):亦維持 gag + LTR 雙標的設計。
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HCV 病毒量檢測標的:
- Roche (CAP/CTM v2.0):5' UTR。
- Abbott (RealTime):5' UTR。
- 注意:較新的 Roche cobas 6800/8800 HCV 試劑採用了 Dual Target (5' UTR + Core) 以進一步提升對抗引物結合位點突變的能力。
參考資料
- Abbott RealTime HIV-1 Package Insert: "The target sequence for the Abbott RealTime HIV-1 assay is in the pol integrase region of the HIV-1 genome." (Source: Abbott Molecular)
- Roche cobas AmpliPrep/cobas TaqMan HIV-1 Test, v2.0 Package Insert: "The Master Mix reagent contains primers and probes specific for both HIV-1 gag and LTR regions." (Source: Roche Diagnostics)
- Roche cobas AmpliPrep/cobas TaqMan HCV Test, v2.0 Package Insert: "Uses primers that define a sequence within the highly conserved region of the 5'-untranslated region of the HCV genome." (Source: Roche Diagnostics)