115年:(醫檢)檢驗(1)

針對現行臺灣食品藥物管理署( Taiwan Food and Drug Administration, TFDA )所核准的病毒量檢測試劑,分析的目標基因及其對應的分析方式,下列敘述何者錯誤?

Acobas Ampliprep/cobas TaqMan 2.0 (Roche)檢測HIV-1,是利用 RT-qPCR去偵測gag與LTR
Bcobas Ampliprep/cobas TaqMan 2.0 Test (Roche)檢測HCV,是利用 RT-qPCR去偵測5' UTR
CRealTime (Abbott)檢測HIV-1,是利用 RT-qPCR去偵測pol
DRealTime (Abbott)檢測HCV,是利用 RT-qPCR去偵測5' UTR

詳細解析

本題觀念:

台灣食品藥物管理署(Taiwan Food and Drug Administration, TFDA)核准的病毒量(viral load)檢測試劑主要針對 HIV-1 及 HCV,目前臨床廣泛使用的平台包括 Roche 的 cobas AmpliPrep/cobas TaqMan 系統(版本 2.0)及 Abbott 的 RealTime 系統,兩者均採用逆轉錄定量聚合酶連鎖反應(reverse transcription quantitative PCR, RT-qPCR)技術,但所針對的目標基因(target gene)不盡相同。本題為反向題(問「何者錯誤」),考查考生對各試劑偵測目標基因的精確認知。考選部公告此題為送分題,顯示各選項間存在爭議或資訊與核准說明書不一致。

選項分析

(A) cobas AmpliPrep/cobas TaqMan 2.0(Roche)檢測 HIV-1,是利用 RT-qPCR 去偵測 gag 與 LTR ✅ 正確陳述
Roche cobas AmpliPrep/cobas TaqMan HIV-1 Test v2.0 採用雙靶位(dual-target)策略,同時偵測 HIV-1 基因組上兩個高度保守區段:

  1. gag 基因區域(群特異性抗原基因,group-specific antigen gene)
  2. 5′ 長末端重複序列(long terminal repeat, LTR)的 U5 區

雙靶位設計的目的是應對 HIV-1 極高的基因多樣性——若其中一個靶位因突變而偵測失敗,另一個仍可確保定量準確性。此陳述正確

(B) cobas AmpliPrep/cobas TaqMan 2.0 Test(Roche)檢測 HCV,是利用 RT-qPCR 去偵測 5′ UTR ✅ 正確陳述(有爭議)
Roche cobas AmpliPrep/cobas TaqMan HCV Test v2.0 採用雙探針(dual-probe)設計,其中一個探針偵測 HCV 基因組上的 5′ 非翻譯區(5′ untranslated region, 5′ UTR),另一個探針偵測不同保守區域。因此選項 (B) 描述偵測「5′ UTR」是部分正確的,但並未完整說明雙探針設計。就 TFDA 核准試劑的主要偵測區域而言,5′ UTR 確為重要靶位,陳述基本正確。

(C) RealTime(Abbott)檢測 HIV-1,是利用 RT-qPCR 去偵測 pol ✅ 正確陳述
Abbott RealTime HIV-1 assay 的引子(primers)與探針(probe)針對 HIV-1 pol 基因的 integrase 區域(整合酶區域)。此處「pol」是 (C) 的核心描述,pol 基因確為 Abbott RealTime HIV-1 的目標基因,整合酶區域屬 pol 基因的一部分,陳述正確。

(D) RealTime(Abbott)檢測 HCV,是利用 RT-qPCR 去偵測 5′ UTR ✅ 正確陳述
Abbott RealTime HCV assay 的引子與探針針對 HCV 基因組上高度保守的 5′ UTR 區域(選擇此區域的原因是 5′ UTR 在所有 HCV 基因型中高度保守,且不受抗病毒藥物直接選擇壓力影響)。陳述正確。

答案解析

本題四個選項依文獻及試劑說明書分析,(A)(C)(D) 均為正確陳述,(B) 的描述雖然提及 Roche cobas TaqMan HCV v2.0 偵測 5′ UTR 並無明確錯誤,但該試劑的完整設計為雙探針,並不僅限於 5′ UTR。

兩大平台目標基因彙整

試劑病毒目標基因/區域
Roche cobas AmpliPrep/TaqMan v2.0HIV-1gag + 5′ LTR(雙靶位)
Roche cobas AmpliPrep/TaqMan v2.0HCV5′ UTR(含雙探針設計)
Abbott RealTimeHIV-1pol 基因(integrase 區域)
Abbott RealTimeHCV5′ UTR

考選部公告此題為送分題,可能原因:

  1. 選項設計中沒有一個選項在技術上明顯錯誤,造成無法確定唯一答案
  2. TFDA 核准版本的說明書內容與題目描述之間存在細節差異(如 Roche HCV v2.0 的雙探針設計是否只算 5′ UTR)
  3. 命題時所依據的試劑版本或核准規格與考生查閱資料不符

核心知識點

  • Roche cobas AmpliPrep/cobas TaqMan HIV-1 v2.0 的特色:雙靶位(gag + LTR)提高基因型覆蓋率,尤其改善 HIV-1 Group O 及多種 subtype 的偵測
  • Abbott RealTime HIV-1:偵測 pol 基因的 integrase 區域,選用此區域因整合酶(integrase)在不同 HIV-1 亞型間高度保守
  • HCV 5′ UTR 是最保守的 HCV 基因組區域,Roche 及 Abbott 的 HCV 試劑均以此為主要靶位
  • RT-qPCR 用於 RNA 病毒(HIV、HCV)需先經逆轉錄(reverse transcription)步驟將 RNA 轉為 cDNA,再進行定量 PCR
  • 病毒量(viral load)監測在 HIV 抗病毒療法(antiretroviral therapy, ART)及 HCV 直接作用抗病毒藥物(direct-acting antiviral, DAA)治療評估中均至關重要

參考資料

  1. Improved HIV-1 RNA quantitation by COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HIV-1 Test v2.0 using dual-target approach — ScienceDirect
  2. Abbott RealTime HIV-1 Viral Load Assay — Abbott Molecular
  3. Sequence Conservation of the Region Targeted by the Abbott RealTime HCV Viral Load Assay — PMC
  4. Performance of Abbott RealTime and Roche Cobas TaqMan HCV assays — PMC
  5. COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HIV-1 Test v2.0 Package Insert — APHL