109年:(醫檢)檢驗(1)

以單一鹼基延長作用( Single base extension, SBE )來偵測 single nucleotide polymorphism (SNP ), SNP 所在的位置是:

ASBE primer 5' 端第一個核 苷酸
BSBE primer 3' 端最後一個核 苷酸
C不存在 SBE primer 序列中,是緊接 SBE primer 3' 端後第一個核 苷酸
D不存在 SBE primer 序列中,是緊接 SBE primer 5' 端前第一個核 苷酸

詳細解析

本題觀念:

單一鹼基延長法(single base extension, SBE)是偵測單一核苷酸多形性(single nucleotide polymorphism, SNP)的重要技術。本題考核 SNP 所在位置與 SBE primer 的位置關係。

選項分析

(A) SBE primer 5' 端第一個核苷酸 SBE primer 的 5' 端是其「遠端」,遠離延伸反應的作用點。SBE 技術的作用點在 3' 端,SNP 不位於 5' 端。❌ 錯誤。

(B) SBE primer 3' 端最後一個核苷酸 若 SNP 位於 SBE primer 的 3' 末端核苷酸本身,則 SNP 已被納入 primer 序列中,DNA 聚合酶只需從已包含 SNP 的 primer 繼續延伸,無法區分不同等位基因。這不是 SBE 的設計原理。❌ 錯誤。

(C) 不存在 SBE primer 序列中,是緊接 SBE primer 3' 端後第一個核苷酸 SBE primer 設計為與 SNP 位點緊鄰且上游的序列完全互補,其 3' 末端停在 SNP 位點前一個核苷酸。DNA 聚合酶在 SNP 位點(primer 3' 端後的第一個鹼基)加入一個互補的鏈終止核苷酸(dideoxynucleotide, ddNTP),完成一個鹼基的延長就停

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