109年:(醫檢)檢驗(1)

在病原菌分型時,如何增加隨機複製多型性分析法( RAPD )結果的可信度?

A利用二組以上之引子,分次進行核酸增幅
B使用專一性引子進行核酸增幅
C使用限制 酶切割增幅產物
D使用多對引子在單一反應中進行核酸增幅

詳細解析

本題觀念:

RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA)技術的可信度提升策略

RAPD(隨機複製多型性分析法)是一種低嚴謹度(low stringency)PCR 分型技術,雖操作簡便,但其最大缺點是重現性(reproducibility)差,結果容易受微小實驗條件變化影響。本題考查如何提升 RAPD 結果的可信度。

選項分析

(A) 利用二組以上之引子,分次進行核酸增幅 ✅ 正確答案 使用兩組以上的獨立任意引子,分別進行獨立的 PCR 反應,再將各組條帶圖譜合併分析,是公認最有效提升 RAPD 可信度的策略:

  • 不同引子擴增出不同的隨機片段,提供互補的遺傳資訊
  • 當兩組以上引子的結果一致時,分型結論的可靠性大幅提升
  • 若單一引子因實驗條件微小差異產生偽帶(spurious band),其他引子可作為交叉驗證

文獻建議 RAPD 分型時應使用至少 2 個獨立引子,且以分次反應(separate reactions)而非混合在同一管中進行。

(B) 使用專一性引子進行核酸增幅 使用「專一性引子」進行 PCR 就不再是 RAPD,而是標準 PCR 或 target-specific PCR。RAPD 的定義就是使用任意序列(arbitrary/random)的引子,使用專

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