109年:(醫檢)檢驗(1)

下列分子檢驗方法可以分析癌細胞的染色體基因拷貝數變異( copy number variation, CNV ),何者除外?

A次世代定序儀( Next-generation sequencer )進行全基因體定序
B微陣列比較基因組雜交( array Comparative Genomic Hybridization, aCGH )技術
C次世代定序儀進行轉 錄體核糖核酸定序( RNA-sequencing )
D次世代定序儀進行外顯子組定序( Exome-sequencing )

詳細解析

本題觀念:

本題考查各種分子檢驗方法對染色體基因拷貝數變異(copy number variation, CNV)的偵測能力。CNV 是指基因組中特定區段的拷貝數與正常二倍體不同(增加或減少),在癌症診斷與預後評估上十分重要。

選項分析

(A) 次世代定序儀(Next-generation sequencer)進行全基因體定序(whole genome sequencing, WGS) WGS 對全基因組進行深度覆蓋定序,可偵測 SNV、indel、CNV 及結構變異(structural variants)。利用 read depth(讀取深度)的改變,可精確分析 CNV 的位置與大小。可分析 CNV,非正確答案。

(B) 微陣列比較基因組雜交(array Comparative Genomic Hybridization, aCGH)技術 aCGH 是 CNV 偵測的「黃金標準」技術之一,透過將測試 DNA 與參考 DNA 同時與微陣列雜交,以雜交訊號強度差異直接量化全基因組 CNV。解析度可達 10–25 kb,在臨床與研究上廣泛使用。可分析 CNV,非正確答案。

(C) 次世代定序儀進行轉錄體核糖核酸定序(RNA-sequencing,RNA-seq) RNA-seq 是對 mRNA(轉錄體)進行定序,主要目的

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