107年:藥學一(第1次)

比較圖中 somatostatin 與octreotide 結構,推斷 somatostatin 的essential fragment 為何? 圖片

ACys-S-S-Cys
BPhe-Trp-Lys-Thr
CCys-Lys-Asn-Phe
DLys-Thr-Cys-Thr

詳細解析

本題觀念:

Somatostatin 與其合成類似物 Octreotide 的構效關係(structure-activity relationship, SAR)——辨識 somatostatin 與受體結合所需的 essential fragment(藥效基團 pharmacophore)。

影像分析:

圖中呈現兩個環狀胜肽結構:

Somatostatin(上方):14 個胺基酸序列 Ala-Gly-Cys-Lys-Asn-Phe-Phe-Trp-Lys-Thr-Phe-Thr-Ser-Cys,Cys3 與 Cys14 間形成二硫鍵(S-S)構成環狀骨架。

Octreotide(下方):8 個胺基酸序列 D-Phe-Cys-Phe-D-Trp-Lys-Thr-Cys-Thr-ol,同樣由兩個 Cys 間的二硫鍵形成環狀結構,C 端為醇式(-ol)而非羧酸。

兩者比對的關鍵觀察:

  • Octreotide 是 somatostatin 的最小活性片段濃縮版,保留了核心四殘基序列
  • Somatostatin 中的 Phe-Phe-Trp-Lys-Thr(位置 7-10)對應 Octreotide 中的 Phe-D-Trp-Lys-Thr
  • Octreotide 將 Trp8(somatostatin 編號)改為 D-Trp(

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