107年:(醫檢)檢驗(1)

甲基化的 DNA 序列 5'-ATCTAA mCG-3' 經bisulfite 處理,PCR 增幅,由pyrosequencing 所得結果為何?

A5'-ATCTAATG-3'
B5'-ATTTAACG-3'
C5'-ATCTAACG-3'
D5'-ATTTAATG-3'

詳細解析

本題觀念:

本題考核 bisulfite 定序法偵測 DNA 甲基化的原理,以及 pyrosequencing 最終讀取結果。

選項分析

題目解讀:原始序列為 5'-ATCTAA mCG-3',其中 mC 代表甲基化胞嘧啶(5-methylcytosine, 5mC)。
Bisulfite 處理 → PCR 增幅 → pyrosequencing 的步驟如下:

Bisulfite 處理原則(對單股 DNA):

  • 未甲基化的 Cytosine(C) → 轉化為 Uracil(U)→ PCR 時讀為 Thymine(T)
  • 甲基化的 Cytosine(mC) → 不受 bisulfite 影響,維持為 Cytosine(C)

逐字分析原始序列 5'-ATCTAA mCG-3'

  • A → A(不變)
  • T → T(不變)
  • C → U(bisulfite 轉化) → PCR 讀為 T
  • T → T
  • A → A
  • A → A
  • mC → mC 不被轉化 → PCR 讀為 C
  • G → G(不變)

轉化後 PCR 結果:5'-ATTTAACG-3'

(A) 5'-ATCTAATG-3':第3位 C 未轉化(應為 T),且第7位 mC 被錯誤轉化為 T

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