115年:醫學一(2)

在大腸桿菌的複製體(replisome)結構中,下列那一項蛋白功能描述為錯誤?

ADNA 解旋酶(helicase):緩解複製過程中引入的DNA 超螺旋張力
B單股結合蛋白(single-stranded DNA-binding protein, SSB):負責結合並穩定單股DNA
C引子酶(primase):負責合成RNA 引子
DDNA 聚合酶Ⅲ(polymerase Ⅲ):負責新股DNA 的複製合成

詳細解析

本題觀念

複製體(replisome)是細菌DNA複製時,聚集在複製叉(replication fork)上的一組蛋白質複合體,各自負責不同的分工:解開雙股DNA、穩定單股模板、合成引子、以及進行新股DNA的延伸合成。本題要考的重點,是分辨複製體中每個蛋白質的正確功能,特別是容易被混淆的「解開雙股DNA」與「緩解超螺旋(supercoiling)張力」這兩件不同的工作,分別是由哪一種蛋白質負責。

選項分析

  • A. DNA解旋酶(helicase):解旋酶的真正功能,是破壞雙股DNA之間的氫鍵、把雙螺旋解開,提供單股模板讓其他蛋白質可以讀取進行複製,並不是負責緩解複製過程中產生的超螺旋張力。這股超螺旋張力是解旋酶解開DNA時,在複製叉前方額外累積出來的正超螺旋,實際上是由DNA促旋酶(gyrase,一種第二型拓樸異構酶, topoisomerase II)負責切開並重新接合DNA磷酸骨架來加以消除。因此本選項把促旋酶的工作誤植給解旋酶,功能描述錯誤,為本題答案。
  • B. 單股結合蛋白(single-stranded DNA-binding protein, SSB):SSB的功能正是結合並穩定已經解開的單股DNA,防止其重新配對成雙股,也避免被核酸酶(nuclease)分解,此描述正確,故不符合題目所求。
  • C. 引子酶(primase):引子酶的功能是在模板股上合成一小段RNA引子(RNA primer),提供DNA聚合酶所需的3'-OH端才能開始延伸新股DNA,此描述正確,故不符合題目所求。
  • D. DNA聚合酶Ⅲ(polymerase Ⅲ):聚合酶Ⅲ全酶是複製體中主要負責合成新股DNA的酶,同時執行前導股(leading strand)連續合成與後股(lagging strand)岡崎片段(Okazaki fragment)的不連續合成,此描述正確,故不符合題目所求。

答案解析

本題答案為A。大腸桿菌複製體中,DnaB解旋酶是一個環狀六聚體,套在後股(lagging strand)模板上,以水解ATP提供能量沿5'→3'方向移動,功能是解開雙股DNA的氫鍵、產生單股模板供其他蛋白質作用;然而解旋酶轉動解開雙股DNA的同時,會使複製叉前方DNA被過度扭轉,產生正超螺旋張力,這股張力必須由DNA促旋酶(gyrase)負責緩解,促旋酶會切斷DNA雙股骨架、讓DNA鬆開多餘的扭轉張力後再重新接合。選項A把「緩解超螺旋張力」這項屬於促旋酶的工作,誤植成解旋酶的功能,所以描述錯誤,符合題目所問「錯誤的蛋白功能描述」,答案為A。

核心知識點

準備這類題目時,建議把複製體中各個蛋白質的功能,依照「作用對象」分類記憶:解旋酶(helicase)負責解開雙股DNA的氫鍵;促旋酶/拓樸異構酶(gyrase/topoisomerase)負責消除解旋過程中產生的超螺旋張力;單股結合蛋白(SSB)負責穩定已解開的單股DNA;引子酶(primase)負責合成RNA引子;DNA聚合酶Ⅲ負責延伸合成新股DNA。特別要記住「解旋酶=解開雙股」與「促旋酶=緩解扭轉」是兩種不同蛋白質分工,這是這類考題最常設計的混淆點。

參考資料

  1. Wikipedia: Replisome. https://en.wikipedia.org/wiki/Replisome
  2. ScienceDirect: DnaB Helicase. https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/dnab-helicase
  3. LibreTexts: Prokaryotic Replication. https://bio.libretexts.org/Bookshelves/Cell_and_Molecular_Biology/Book:_Cells_-_Molecules_and_Mechanisms_(Wong)/07:_DNA/7.03:_Prokaryotic_Replication
  4. RevisionDojo: Roles of Helicase and Topoisomerase in Replication. https://www.revisiondojo.com/blog/roles-of-helicase-and-topoisomerase-in-replication