115年:醫學一(2)
基因轉錄作用中,RNA 聚合酶(RNA polymerase)催化的反應不需要下列何者?
A四種ribonucleoside 5'-triphosphates
B引子(primer)
C鎂離子
DDNA 模板
詳細解析
本題觀念
RNA聚合酶(RNA polymerase)進行基因轉錄(transcription)時,需要辨識DNA上的啟動子(promoter)序列,並依照模板股(template strand)的鹼基序列,把游離的核糖核苷三磷酸(ribonucleoside 5'-triphosphate)一個個接上去,形成新的RNA鏈。這個聚合反應和DNA複製(replication)時DNA聚合酶(DNA polymerase)的作用方式十分相似,但兩者在「如何起始合成」這件事上有一個關鍵差異,也正是本題要考的重點。
選項分析
- A. 四種ribonucleoside 5'-triphosphates(即ATP、GTP、UTP、CTP):這四種帶有三個磷酸根的核糖核苷酸,是合成RNA鏈的原料。RNA聚合酶每接上一個核苷酸,就會切下其中兩個磷酸根(釋出焦磷酸)、提供合成RNA所需的能量並延長RNA鏈,因此這四種原料是RNA聚合酶催化反應時必須具備的成分,並非本題所問「不需要」的項目。
- B. 引子(primer):DNA聚合酶因為只能在既有的3'端上延伸鏈,必須依賴引子酶(primase)先合成一小段RNA引子,才能開始複製DNA。但RNA聚合酶不同,它具備「從頭起始」(de novo initiation)的能力,只要辨識到啟動子序列,就能直接開始合成第一個核苷酸鍵結,完全不需要事先存在的引子。這正是轉錄作用和DNA複製在起始機轉上最大的差異,也是本題答案。
- C. 鎂離子(Mg²⁺):鎂離子是RNA聚合酶催化反應偏好使用的二價金屬輔因子,作用是幫助固定新進核苷酸的磷酸根位置,協助磷酸雙酯鍵順利形成。缺少鎂離子(或替代的錳離子),RNA聚合酶便無法有效催化聚合反應,因此鎂離子是必需成分,並非本題所問「不需要」的項目。
- D. DNA模板:轉錄作用的本質就是「以DNA其中一股當模板,合成互補的RNA鏈」,RNA聚合酶必須辨識模板股上的鹼基序列才能決定要接上哪一個核苷酸。沒有DNA模板,轉錄作用根本無法進行,因此DNA模板同樣是必需成分,並非本題所問「不需要」的項目。
答案解析
本題答案為B。判斷這類「不需要哪個成分」的題目,最有效的方法是先掌握轉錄反應的基本需求:一段含啟動子的DNA模板、RNA聚合酶本身、四種核糖核苷三磷酸做原料,以及鎂離子做輔因子,這四項都是缺一不可的必需品。真正的差異點在於「起始方式」:DNA聚合酶只能延伸既有鏈,因此需要引子酶合成的RNA引子當作起點;RNA聚合酶則具備從頭起始的能力,能直接辨識啟動子後開始合成,完全不需要引子。這也是為什麼細胞在啟動DNA複製時,會先由引子酶這種特化的RNA聚合酶合成短RNA引子,再交給DNA聚合酶接手延伸的原因。
核心知識點
複習這題時,建議把轉錄作用與DNA複製的起始機轉並列比較:DNA聚合酶必須依賴引子酶合成的RNA引子才能起步,因為它只能在既有3'-OH端上加長鏈;RNA聚合酶則能直接辨識啟動子、從頭開始合成RNA,不需要任何引子。至於四種核糖核苷三磷酸、鎂離子與DNA模板,則是DNA複製和轉錄作用兩者都需要的共通必需品,不要與「起始是否需要引子」這個關鍵差異混淆。日後遇到類似「哪種聚合酶需要或不需要引子」的考題,只要記住「DNA聚合酶需要引子、RNA聚合酶不需要」這條規則,就能快速作答。
參考資料
- Does RNA polymerase need a primer? https://www.aatbio.com/resources/faq-frequently-asked-questions/Does-RNA-polymerase-need-a-primer
- No primer needed. https://virology.ws/2019/06/13/no-primer-needed/
- Biochemistry, RNA Polymerase (StatPearls). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK545212/
- Transcription Reaction Basics. https://www.trilinkbiotech.com/resources/docs/transcription-reaction-basics
- RNA Polymerase: Definition, Properties, Structure, Types, Functions. https://microbenotes.com/rna-polymerase-definition-properties-structure-types-functions/