112年:(醫檢)檢驗(1)
DNA 定序法用於進行真菌鑑定時,下列敘述何者最正確?
A核糖體核酸基因不是主要的鑑定標的
BITS(internal transcribed spacer)與 D1/D2 兩段基因序列是真菌分型的標的
C真菌的核糖體基因有高拷貝數且序列具高變異性的特性
D真菌的 rRNA 包括 18S, 5S, 23S三種
詳細解析
本題觀念:
真菌分子鑑定常以核糖體基因(rRNA gene)中的高拷貝非編碼區域(Internal Transcribed Spacer, ITS)及大次單元(rRNA large subunit)的D1/D2區段作為バーコード(barcode),藉由其高變異性與保守序列的結合,達到物種與種內區分的目的。
選項分析
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選項A 「核糖體核酸基因不是主要的鑑定標的」
錯誤。臨床與研究常以rRNA基因群(rDNA operon)做為放大並鑑定真菌的首選區域,其中包含保守的18S、5.8S、28S及兩個高變異ITS區段,尤其ITS已被公認為真菌分子標識的“バーコード”(nexusacademicpublishers.com)。 -
選項B 「ITS(internal transcribed spacer)與 D1/D2 兩段基因序列是真菌分型的標的」
正確。多篇研究顯示,以ITS1、ITS2與大次單元28S rRNA的D1/D2區段序列共同放大和定序,可達到高達92%以上的酵母菌種層識別率及75%以上的絲狀菌識別率([pubmed.n
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