112年:(醫檢)檢驗(1)
Allele-specific oligonucleotide hybridization 廣泛使用在癌症與遺傳疾病的分子鑑定上,,在探針的設計上,下列敘述何者最適當?
A序列長度大約在 20個核苷酸左右
B擬偵測之單一核苷酸差異點最好設計在 3'末端鹼基位置
C只需設計偵測突變的探針即可
D檢測靈敏度與特異性都很高
詳細解析
本題觀念:
Allele-specific oligonucleotide (ASO) hybridization 用於偵測基因中的單一核苷酸差異(SNPs)或突變,關鍵在於探針設計必須兼顧對野生型(wild-type)與突變型(mutant)單株之辨識能力。探針通常需足夠短以對單一錯配敏感,同時長度又要足以維持與目標序列的結合穩定性。
選項分析
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選項A
ASO 探針理想長度約 19–21 個核苷酸。探針太長會降低錯配辨識能力(specificity),太短則可能因結合不穩定而影響訊號(sensitivity)。若設計在這個長度範圍,能在「足夠結合」與「強化錯配分辨」之間取得平衡 (informatics.jax.org)(bmcgenomics.biomedcentral.com)。 -
選項B
若將單一核苷酸差異置於探針 3′ 末端(terminal mismatch),會因末端錯
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